Em 1991, numa parceria entre a APM e o Cremesp, é criado o programa Compromisso com a Qualidade Hospitalar (CQH).
No dia 17 de outubro de 1997, a Associação Paulista de Medicina inaugura sua biblioteca, que atualmente reúne mais de 40 mil títulos, entre livros, obras raras, teses, DVDs, jornais e revistas.